Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWJ9

SNX30, Sorting nexin-30, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX30Q5VWJ9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX30Q5VWJ9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX30Q5VWJ9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX30Q5VWJ9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX30Q5VWJ9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX30Q5VWJ9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX30Q5VWJ9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX30Q5VWJ9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX30Q5VWJ9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX30Q5VWJ9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX30Q5VWJ9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX30Q5VWJ9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX30Q5VWJ9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX30Q5VWJ9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX30Q5VWJ9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX30Q5VWJ9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX30Q5VWJ9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX30Q5VWJ9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX30Q5VWJ9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SNX30Q5VWJ9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX30Q5VWJ9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX30Q5VWJ9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms