Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BROXQ5VW32 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BROXQ5VW32 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BROXQ5VW32 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms