Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
C1orf53Q5VUE5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
C1orf53Q5VUE5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
C1orf53Q5VUE5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
C1orf53Q5VUE5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
C1orf53Q5VUE5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C1orf53Q5VUE5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C1orf53Q5VUE5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
C1orf53Q5VUE5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C1orf53Q5VUE5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C1orf53Q5VUE5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
C1orf53Q5VUE5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C1orf53Q5VUE5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C1orf53Q5VUE5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C1orf53Q5VUE5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C1orf53Q5VUE5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C1orf53Q5VUE5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
C1orf53Q5VUE5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
C1orf53Q5VUE5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C1orf53Q5VUE5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C1orf53Q5VUE5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C1orf53Q5VUE5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C1orf53Q5VUE5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
C1orf53Q5VUE5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C1orf53Q5VUE5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C1orf53Q5VUE5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C1orf53Q5VUE5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C1orf53Q5VUE5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C1orf53Q5VUE5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C1orf53Q5VUE5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
C1orf53Q5VUE5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C1orf53Q5VUE5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C1orf53Q5VUE5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
C1orf53Q5VUE5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C1orf53Q5VUE5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
C1orf53Q5VUE5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C1orf53Q5VUE5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
C1orf53Q5VUE5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
C1orf53Q5VUE5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
C1orf53Q5VUE5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
C1orf53Q5VUE5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
C1orf53Q5VUE5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
C1orf53Q5VUE5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C1orf53Q5VUE5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C1orf53Q5VUE5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
C1orf53Q5VUE5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C1orf53Q5VUE5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C1orf53Q5VUE5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C1orf53Q5VUE5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C1orf53Q5VUE5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C1orf53Q5VUE5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C1orf53Q5VUE5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C1orf53Q5VUE5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C1orf53Q5VUE5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C1orf53Q5VUE5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C1orf53Q5VUE5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C1orf53Q5VUE5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C1orf53Q5VUE5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
C1orf53Q5VUE5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
C1orf53Q5VUE5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C1orf53Q5VUE5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C1orf53Q5VUE5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C1orf53Q5VUE5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C1orf53Q5VUE5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C1orf53Q5VUE5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C1orf53Q5VUE5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C1orf53Q5VUE5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C1orf53Q5VUE5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
C1orf53Q5VUE5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
C1orf53Q5VUE5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
C1orf53Q5VUE5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C1orf53Q5VUE5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms