Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q3

MEX3C, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEX3CQ5U5Q3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
MEX3CQ5U5Q3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
MEX3CQ5U5Q3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
MEX3CQ5U5Q3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
MEX3CQ5U5Q3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
MEX3CQ5U5Q3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
MEX3CQ5U5Q3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
MEX3CQ5U5Q3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
MEX3CQ5U5Q3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
MEX3CQ5U5Q3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
MEX3CQ5U5Q3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
MEX3CQ5U5Q3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
MEX3CQ5U5Q3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
MEX3CQ5U5Q3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
MEX3CQ5U5Q3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
MEX3CQ5U5Q3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
MEX3CQ5U5Q3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
MEX3CQ5U5Q3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
MEX3CQ5U5Q3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
MEX3CQ5U5Q3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
MEX3CQ5U5Q3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
MEX3CQ5U5Q3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
MEX3CQ5U5Q3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
MEX3CQ5U5Q3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
MEX3CQ5U5Q3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
MEX3CQ5U5Q3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
MEX3CQ5U5Q3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
MEX3CQ5U5Q3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
MEX3CQ5U5Q3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
MEX3CQ5U5Q3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
MEX3CQ5U5Q3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
MEX3CQ5U5Q3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
MEX3CQ5U5Q3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
MEX3CQ5U5Q3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
MEX3CQ5U5Q3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
MEX3CQ5U5Q3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
MEX3CQ5U5Q3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
MEX3CQ5U5Q3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
MEX3CQ5U5Q3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
MEX3CQ5U5Q3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
MEX3CQ5U5Q3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
MEX3CQ5U5Q3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
MEX3CQ5U5Q3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
MEX3CQ5U5Q3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
MEX3CQ5U5Q3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
MEX3CQ5U5Q3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
MEX3CQ5U5Q3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
MEX3CQ5U5Q3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
MEX3CQ5U5Q3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
MEX3CQ5U5Q3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
MEX3CQ5U5Q3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
MEX3CQ5U5Q3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
MEX3CQ5U5Q3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
MEX3CQ5U5Q3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
MEX3CQ5U5Q3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
MEX3CQ5U5Q3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MEX3CQ5U5Q3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MEX3CQ5U5Q3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MEX3CQ5U5Q3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
MEX3CQ5U5Q3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
MEX3CQ5U5Q3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
MEX3CQ5U5Q3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
MEX3CQ5U5Q3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
MEX3CQ5U5Q3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
MEX3CQ5U5Q3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
MEX3CQ5U5Q3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
MEX3CQ5U5Q3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
MEX3CQ5U5Q3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
MEX3CQ5U5Q3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
MEX3CQ5U5Q3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
MEX3CQ5U5Q3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
MEX3CQ5U5Q3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
MEX3CQ5U5Q3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
MEX3CQ5U5Q3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
MEX3CQ5U5Q3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
MEX3CQ5U5Q3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
MEX3CQ5U5Q3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
MEX3CQ5U5Q3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
MEX3CQ5U5Q3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
MEX3CQ5U5Q3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
MEX3CQ5U5Q3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
MEX3CQ5U5Q3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
MEX3CQ5U5Q3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
MEX3CQ5U5Q3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
MEX3CQ5U5Q3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
MEX3CQ5U5Q3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MEX3CQ5U5Q3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MEX3CQ5U5Q3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MEX3CQ5U5Q3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
MEX3CQ5U5Q3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
MEX3CQ5U5Q3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MEX3CQ5U5Q3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
MEX3CQ5U5Q3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
MEX3CQ5U5Q3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
MEX3CQ5U5Q3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
MEX3CQ5U5Q3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC32.28■■■□□ 2.76
MEX3CQ5U5Q3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
MEX3CQ5U5Q3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
MEX3CQ5U5Q3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
MEX3CQ5U5Q3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms