Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C1orf220Q5T0J3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C1orf220Q5T0J3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C1orf220Q5T0J3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C1orf220Q5T0J3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C1orf220Q5T0J3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C1orf220Q5T0J3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
C1orf220Q5T0J3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C1orf220Q5T0J3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C1orf220Q5T0J3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C1orf220Q5T0J3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C1orf220Q5T0J3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C1orf220Q5T0J3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C1orf220Q5T0J3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C1orf220Q5T0J3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C1orf220Q5T0J3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
C1orf220Q5T0J3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
C1orf220Q5T0J3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C1orf220Q5T0J3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C1orf220Q5T0J3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1orf220Q5T0J3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1orf220Q5T0J3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1orf220Q5T0J3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1orf220Q5T0J3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1orf220Q5T0J3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C1orf220Q5T0J3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C1orf220Q5T0J3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C1orf220Q5T0J3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C1orf220Q5T0J3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C1orf220Q5T0J3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
C1orf220Q5T0J3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
C1orf220Q5T0J3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C1orf220Q5T0J3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C1orf220Q5T0J3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C1orf220Q5T0J3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
C1orf220Q5T0J3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms