Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW19

Cluh, Clustered mitochondria protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluhQ5SW19 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CluhQ5SW19 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CluhQ5SW19 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CluhQ5SW19 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CluhQ5SW19 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CluhQ5SW19 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CluhQ5SW19 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CluhQ5SW19 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CluhQ5SW19 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CluhQ5SW19 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CluhQ5SW19 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CluhQ5SW19 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CluhQ5SW19 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CluhQ5SW19 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CluhQ5SW19 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CluhQ5SW19 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CluhQ5SW19 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CluhQ5SW19 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CluhQ5SW19 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CluhQ5SW19 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CluhQ5SW19 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CluhQ5SW19 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CluhQ5SW19 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CluhQ5SW19 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CluhQ5SW19 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CluhQ5SW19 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CluhQ5SW19 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CluhQ5SW19 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CluhQ5SW19 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CluhQ5SW19 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CluhQ5SW19 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CluhQ5SW19 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CluhQ5SW19 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CluhQ5SW19 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CluhQ5SW19 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CluhQ5SW19 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CluhQ5SW19 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CluhQ5SW19 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CluhQ5SW19 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CluhQ5SW19 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CluhQ5SW19 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CluhQ5SW19 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CluhQ5SW19 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CluhQ5SW19 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CluhQ5SW19 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CluhQ5SW19 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CluhQ5SW19 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CluhQ5SW19 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CluhQ5SW19 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CluhQ5SW19 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CluhQ5SW19 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CluhQ5SW19 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CluhQ5SW19 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CluhQ5SW19 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CluhQ5SW19 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CluhQ5SW19 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CluhQ5SW19 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CluhQ5SW19 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CluhQ5SW19 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CluhQ5SW19 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CluhQ5SW19 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CluhQ5SW19 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CluhQ5SW19 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CluhQ5SW19 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CluhQ5SW19 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CluhQ5SW19 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CluhQ5SW19 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CluhQ5SW19 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CluhQ5SW19 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CluhQ5SW19 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CluhQ5SW19 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CluhQ5SW19 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CluhQ5SW19 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CluhQ5SW19 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CluhQ5SW19 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CluhQ5SW19 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CluhQ5SW19 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CluhQ5SW19 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CluhQ5SW19 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CluhQ5SW19 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CluhQ5SW19 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CluhQ5SW19 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CluhQ5SW19 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CluhQ5SW19 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CluhQ5SW19 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CluhQ5SW19 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CluhQ5SW19 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CluhQ5SW19 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CluhQ5SW19 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CluhQ5SW19 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CluhQ5SW19 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CluhQ5SW19 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CluhQ5SW19 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms