Protein–RNA interactions for Protein: Q5ST30

VARS2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS2Q5ST30 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VARS2Q5ST30 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
VARS2Q5ST30 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VARS2Q5ST30 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VARS2Q5ST30 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VARS2Q5ST30 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
VARS2Q5ST30 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VARS2Q5ST30 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VARS2Q5ST30 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VARS2Q5ST30 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VARS2Q5ST30 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VARS2Q5ST30 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms