Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc85aQ5SP85 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc85aQ5SP85 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc85aQ5SP85 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc85aQ5SP85 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc85aQ5SP85 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc85aQ5SP85 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc85aQ5SP85 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc85aQ5SP85 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc85aQ5SP85 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc85aQ5SP85 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc85aQ5SP85 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc85aQ5SP85 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc85aQ5SP85 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc85aQ5SP85 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc85aQ5SP85 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc85aQ5SP85 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc85aQ5SP85 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc85aQ5SP85 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc85aQ5SP85 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc85aQ5SP85 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc85aQ5SP85 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc85aQ5SP85 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc85aQ5SP85 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc85aQ5SP85 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc85aQ5SP85 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc85aQ5SP85 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc85aQ5SP85 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc85aQ5SP85 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc85aQ5SP85 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc85aQ5SP85 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc85aQ5SP85 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc85aQ5SP85 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc85aQ5SP85 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc85aQ5SP85 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc85aQ5SP85 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc85aQ5SP85 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc85aQ5SP85 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc85aQ5SP85 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc85aQ5SP85 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc85aQ5SP85 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc85aQ5SP85 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc85aQ5SP85 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc85aQ5SP85 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc85aQ5SP85 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc85aQ5SP85 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc85aQ5SP85 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc85aQ5SP85 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc85aQ5SP85 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc85aQ5SP85 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc85aQ5SP85 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc85aQ5SP85 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc85aQ5SP85 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc85aQ5SP85 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc85aQ5SP85 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc85aQ5SP85 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc85aQ5SP85 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc85aQ5SP85 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc85aQ5SP85 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc85aQ5SP85 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms