Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Mdc1Q5PSV9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Mdc1Q5PSV9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Mdc1Q5PSV9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Mdc1Q5PSV9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Mdc1Q5PSV9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Mdc1Q5PSV9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Mdc1Q5PSV9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Mdc1Q5PSV9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Mdc1Q5PSV9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Mdc1Q5PSV9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Mdc1Q5PSV9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Mdc1Q5PSV9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Mdc1Q5PSV9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Mdc1Q5PSV9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Mdc1Q5PSV9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Mdc1Q5PSV9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Mdc1Q5PSV9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Mdc1Q5PSV9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Mdc1Q5PSV9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Mdc1Q5PSV9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Mdc1Q5PSV9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Mdc1Q5PSV9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Mdc1Q5PSV9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Mdc1Q5PSV9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Mdc1Q5PSV9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Mdc1Q5PSV9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Mdc1Q5PSV9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Mdc1Q5PSV9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Mdc1Q5PSV9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Mdc1Q5PSV9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Mdc1Q5PSV9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Mdc1Q5PSV9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Mdc1Q5PSV9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Mdc1Q5PSV9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Mdc1Q5PSV9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Mdc1Q5PSV9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Mdc1Q5PSV9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Mdc1Q5PSV9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Mdc1Q5PSV9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Mdc1Q5PSV9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Mdc1Q5PSV9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Mdc1Q5PSV9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Mdc1Q5PSV9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Mdc1Q5PSV9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Mdc1Q5PSV9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mdc1Q5PSV9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mdc1Q5PSV9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mdc1Q5PSV9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mdc1Q5PSV9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mdc1Q5PSV9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Mdc1Q5PSV9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Mdc1Q5PSV9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Mdc1Q5PSV9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Mdc1Q5PSV9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Mdc1Q5PSV9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Mdc1Q5PSV9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Mdc1Q5PSV9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Mdc1Q5PSV9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Mdc1Q5PSV9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Mdc1Q5PSV9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Mdc1Q5PSV9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Mdc1Q5PSV9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Mdc1Q5PSV9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Mdc1Q5PSV9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Mdc1Q5PSV9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Mdc1Q5PSV9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Mdc1Q5PSV9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Mdc1Q5PSV9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Mdc1Q5PSV9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Mdc1Q5PSV9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Mdc1Q5PSV9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Mdc1Q5PSV9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Mdc1Q5PSV9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Mdc1Q5PSV9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Mdc1Q5PSV9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Mdc1Q5PSV9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mdc1Q5PSV9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mdc1Q5PSV9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mdc1Q5PSV9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mdc1Q5PSV9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mdc1Q5PSV9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mdc1Q5PSV9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Mdc1Q5PSV9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Mdc1Q5PSV9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Mdc1Q5PSV9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Mdc1Q5PSV9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Mdc1Q5PSV9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mdc1Q5PSV9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Mdc1Q5PSV9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Mdc1Q5PSV9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Mdc1Q5PSV9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Mdc1Q5PSV9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Mdc1Q5PSV9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Mdc1Q5PSV9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Mdc1Q5PSV9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Mdc1Q5PSV9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Mdc1Q5PSV9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Mdc1Q5PSV9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Mdc1Q5PSV9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.1 ms