Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTSL3PQ5NE16 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSL3PQ5NE16 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSL3PQ5NE16 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSL3PQ5NE16 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSL3PQ5NE16 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSL3PQ5NE16 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSL3PQ5NE16 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSL3PQ5NE16 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSL3PQ5NE16 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSL3PQ5NE16 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSL3PQ5NE16 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSL3PQ5NE16 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSL3PQ5NE16 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSL3PQ5NE16 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSL3PQ5NE16 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSL3PQ5NE16 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSL3PQ5NE16 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSL3PQ5NE16 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSL3PQ5NE16 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTSL3PQ5NE16 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTSL3PQ5NE16 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTSL3PQ5NE16 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTSL3PQ5NE16 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTSL3PQ5NE16 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CTSL3PQ5NE16 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTSL3PQ5NE16 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTSL3PQ5NE16 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSL3PQ5NE16 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSL3PQ5NE16 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 230.6 ms