Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rapgef6Q5NCJ1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rapgef6Q5NCJ1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Rapgef6Q5NCJ1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rapgef6Q5NCJ1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rapgef6Q5NCJ1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rapgef6Q5NCJ1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Rapgef6Q5NCJ1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Rapgef6Q5NCJ1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rapgef6Q5NCJ1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rapgef6Q5NCJ1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rapgef6Q5NCJ1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rapgef6Q5NCJ1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rapgef6Q5NCJ1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rapgef6Q5NCJ1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rapgef6Q5NCJ1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rapgef6Q5NCJ1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rapgef6Q5NCJ1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rapgef6Q5NCJ1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rapgef6Q5NCJ1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rapgef6Q5NCJ1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rapgef6Q5NCJ1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rapgef6Q5NCJ1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Rapgef6Q5NCJ1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Rapgef6Q5NCJ1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rapgef6Q5NCJ1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rapgef6Q5NCJ1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rapgef6Q5NCJ1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rapgef6Q5NCJ1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rapgef6Q5NCJ1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rapgef6Q5NCJ1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Rapgef6Q5NCJ1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Rapgef6Q5NCJ1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Rapgef6Q5NCJ1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rapgef6Q5NCJ1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rapgef6Q5NCJ1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rapgef6Q5NCJ1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rapgef6Q5NCJ1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rapgef6Q5NCJ1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rapgef6Q5NCJ1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Rapgef6Q5NCJ1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rapgef6Q5NCJ1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rapgef6Q5NCJ1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rapgef6Q5NCJ1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rapgef6Q5NCJ1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Rapgef6Q5NCJ1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rapgef6Q5NCJ1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rapgef6Q5NCJ1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rapgef6Q5NCJ1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rapgef6Q5NCJ1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Rapgef6Q5NCJ1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Rapgef6Q5NCJ1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Rapgef6Q5NCJ1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Rapgef6Q5NCJ1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Rapgef6Q5NCJ1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Rapgef6Q5NCJ1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Rapgef6Q5NCJ1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rapgef6Q5NCJ1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rapgef6Q5NCJ1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rapgef6Q5NCJ1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rapgef6Q5NCJ1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rapgef6Q5NCJ1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rapgef6Q5NCJ1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rapgef6Q5NCJ1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rapgef6Q5NCJ1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rapgef6Q5NCJ1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rapgef6Q5NCJ1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rapgef6Q5NCJ1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rapgef6Q5NCJ1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Rapgef6Q5NCJ1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rapgef6Q5NCJ1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rapgef6Q5NCJ1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rapgef6Q5NCJ1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rapgef6Q5NCJ1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rapgef6Q5NCJ1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rapgef6Q5NCJ1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Rapgef6Q5NCJ1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Rapgef6Q5NCJ1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Rapgef6Q5NCJ1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Rapgef6Q5NCJ1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
Rapgef6Q5NCJ1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC33■■■□□ 2.87
Rapgef6Q5NCJ1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Rapgef6Q5NCJ1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rapgef6Q5NCJ1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rapgef6Q5NCJ1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rapgef6Q5NCJ1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rapgef6Q5NCJ1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rapgef6Q5NCJ1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rapgef6Q5NCJ1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Rapgef6Q5NCJ1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Rapgef6Q5NCJ1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Rapgef6Q5NCJ1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rapgef6Q5NCJ1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rapgef6Q5NCJ1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rapgef6Q5NCJ1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms