Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rtl5Q5DTT4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rtl5Q5DTT4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rtl5Q5DTT4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rtl5Q5DTT4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rtl5Q5DTT4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rtl5Q5DTT4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rtl5Q5DTT4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rtl5Q5DTT4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rtl5Q5DTT4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rtl5Q5DTT4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rtl5Q5DTT4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rtl5Q5DTT4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rtl5Q5DTT4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rtl5Q5DTT4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rtl5Q5DTT4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rtl5Q5DTT4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rtl5Q5DTT4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rtl5Q5DTT4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rtl5Q5DTT4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rtl5Q5DTT4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rtl5Q5DTT4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rtl5Q5DTT4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Rtl5Q5DTT4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rtl5Q5DTT4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rtl5Q5DTT4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rtl5Q5DTT4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rtl5Q5DTT4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rtl5Q5DTT4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rtl5Q5DTT4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rtl5Q5DTT4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rtl5Q5DTT4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Rtl5Q5DTT4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rtl5Q5DTT4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rtl5Q5DTT4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rtl5Q5DTT4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rtl5Q5DTT4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rtl5Q5DTT4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rtl5Q5DTT4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rtl5Q5DTT4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rtl5Q5DTT4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rtl5Q5DTT4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rtl5Q5DTT4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rtl5Q5DTT4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rtl5Q5DTT4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rtl5Q5DTT4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rtl5Q5DTT4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rtl5Q5DTT4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rtl5Q5DTT4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rtl5Q5DTT4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Rtl5Q5DTT4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rtl5Q5DTT4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rtl5Q5DTT4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rtl5Q5DTT4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rtl5Q5DTT4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rtl5Q5DTT4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rtl5Q5DTT4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rtl5Q5DTT4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rtl5Q5DTT4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rtl5Q5DTT4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rtl5Q5DTT4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rtl5Q5DTT4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rtl5Q5DTT4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rtl5Q5DTT4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rtl5Q5DTT4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rtl5Q5DTT4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rtl5Q5DTT4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rtl5Q5DTT4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rtl5Q5DTT4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rtl5Q5DTT4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rtl5Q5DTT4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rtl5Q5DTT4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rtl5Q5DTT4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rtl5Q5DTT4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rtl5Q5DTT4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rtl5Q5DTT4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rtl5Q5DTT4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rtl5Q5DTT4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rtl5Q5DTT4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rtl5Q5DTT4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rtl5Q5DTT4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rtl5Q5DTT4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rtl5Q5DTT4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rtl5Q5DTT4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rtl5Q5DTT4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rtl5Q5DTT4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rtl5Q5DTT4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rtl5Q5DTT4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rtl5Q5DTT4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rtl5Q5DTT4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rtl5Q5DTT4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rtl5Q5DTT4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rtl5Q5DTT4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rtl5Q5DTT4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rtl5Q5DTT4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rtl5Q5DTT4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rtl5Q5DTT4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rtl5Q5DTT4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rtl5Q5DTT4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rtl5Q5DTT4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms