Protein–RNA interactions for Protein: Q5D1E8

ZC3H12A, Endoribonuclease ZC3H12A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12AQ5D1E8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZC3H12AQ5D1E8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZC3H12AQ5D1E8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ZC3H12AQ5D1E8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZC3H12AQ5D1E8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZC3H12AQ5D1E8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZC3H12AQ5D1E8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZC3H12AQ5D1E8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZC3H12AQ5D1E8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZC3H12AQ5D1E8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZC3H12AQ5D1E8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZC3H12AQ5D1E8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZC3H12AQ5D1E8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZC3H12AQ5D1E8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZC3H12AQ5D1E8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZC3H12AQ5D1E8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZC3H12AQ5D1E8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZC3H12AQ5D1E8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZC3H12AQ5D1E8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZC3H12AQ5D1E8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZC3H12AQ5D1E8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZC3H12AQ5D1E8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZC3H12AQ5D1E8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZC3H12AQ5D1E8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZC3H12AQ5D1E8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZC3H12AQ5D1E8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZC3H12AQ5D1E8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZC3H12AQ5D1E8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms