Protein–RNA interactions for Protein: Q52KI8

Srrm1, Serine/arginine repetitive matrix protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm1Q52KI8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Srrm1Q52KI8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Srrm1Q52KI8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Srrm1Q52KI8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Srrm1Q52KI8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Srrm1Q52KI8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srrm1Q52KI8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srrm1Q52KI8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Srrm1Q52KI8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Srrm1Q52KI8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Srrm1Q52KI8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Srrm1Q52KI8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srrm1Q52KI8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srrm1Q52KI8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srrm1Q52KI8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Srrm1Q52KI8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Srrm1Q52KI8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srrm1Q52KI8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srrm1Q52KI8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srrm1Q52KI8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srrm1Q52KI8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srrm1Q52KI8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srrm1Q52KI8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srrm1Q52KI8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srrm1Q52KI8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srrm1Q52KI8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srrm1Q52KI8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srrm1Q52KI8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srrm1Q52KI8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srrm1Q52KI8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srrm1Q52KI8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srrm1Q52KI8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srrm1Q52KI8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srrm1Q52KI8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Srrm1Q52KI8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Srrm1Q52KI8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Srrm1Q52KI8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Srrm1Q52KI8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Srrm1Q52KI8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Srrm1Q52KI8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Srrm1Q52KI8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Srrm1Q52KI8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Srrm1Q52KI8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Srrm1Q52KI8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Srrm1Q52KI8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Srrm1Q52KI8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms