Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC38Q502W7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC38Q502W7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC38Q502W7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC38Q502W7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC38Q502W7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC38Q502W7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC38Q502W7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC38Q502W7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC38Q502W7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC38Q502W7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC38Q502W7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC38Q502W7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC38Q502W7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC38Q502W7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC38Q502W7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC38Q502W7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC38Q502W7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms