Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
KHDC1Q4VXA5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KHDC1Q4VXA5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms