Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP13A4Q4VNC1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP13A4Q4VNC1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP13A4Q4VNC1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP13A4Q4VNC1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP13A4Q4VNC1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP13A4Q4VNC1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP13A4Q4VNC1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP13A4Q4VNC1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP13A4Q4VNC1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP13A4Q4VNC1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP13A4Q4VNC1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP13A4Q4VNC1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP13A4Q4VNC1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP13A4Q4VNC1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP13A4Q4VNC1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP13A4Q4VNC1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP13A4Q4VNC1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP13A4Q4VNC1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP13A4Q4VNC1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP13A4Q4VNC1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP13A4Q4VNC1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP13A4Q4VNC1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP13A4Q4VNC1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP13A4Q4VNC1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP13A4Q4VNC1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP13A4Q4VNC1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP13A4Q4VNC1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP13A4Q4VNC1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP13A4Q4VNC1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP13A4Q4VNC1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP13A4Q4VNC1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP13A4Q4VNC1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATP13A4Q4VNC1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATP13A4Q4VNC1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP13A4Q4VNC1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms