Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Shank3Q4ACU6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Shank3Q4ACU6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Shank3Q4ACU6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Shank3Q4ACU6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Shank3Q4ACU6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Shank3Q4ACU6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Shank3Q4ACU6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Shank3Q4ACU6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Shank3Q4ACU6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Shank3Q4ACU6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Shank3Q4ACU6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Shank3Q4ACU6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Shank3Q4ACU6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Shank3Q4ACU6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Shank3Q4ACU6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Shank3Q4ACU6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Shank3Q4ACU6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Shank3Q4ACU6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Shank3Q4ACU6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Shank3Q4ACU6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Shank3Q4ACU6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Shank3Q4ACU6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Shank3Q4ACU6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Shank3Q4ACU6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Shank3Q4ACU6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Shank3Q4ACU6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Shank3Q4ACU6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Shank3Q4ACU6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Shank3Q4ACU6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Shank3Q4ACU6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Shank3Q4ACU6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Shank3Q4ACU6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Shank3Q4ACU6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Shank3Q4ACU6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Shank3Q4ACU6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Shank3Q4ACU6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Shank3Q4ACU6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Shank3Q4ACU6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Shank3Q4ACU6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.54■■■□□ 2
Shank3Q4ACU6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Shank3Q4ACU6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Shank3Q4ACU6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Shank3Q4ACU6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Shank3Q4ACU6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Shank3Q4ACU6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Shank3Q4ACU6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Shank3Q4ACU6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Shank3Q4ACU6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Shank3Q4ACU6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Shank3Q4ACU6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Shank3Q4ACU6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Shank3Q4ACU6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Shank3Q4ACU6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Shank3Q4ACU6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Shank3Q4ACU6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Shank3Q4ACU6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Shank3Q4ACU6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Shank3Q4ACU6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Shank3Q4ACU6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Shank3Q4ACU6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Shank3Q4ACU6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Shank3Q4ACU6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Shank3Q4ACU6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Shank3Q4ACU6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Shank3Q4ACU6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Shank3Q4ACU6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Shank3Q4ACU6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Shank3Q4ACU6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Shank3Q4ACU6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Shank3Q4ACU6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Shank3Q4ACU6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Shank3Q4ACU6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Shank3Q4ACU6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Shank3Q4ACU6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Shank3Q4ACU6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Shank3Q4ACU6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Shank3Q4ACU6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Shank3Q4ACU6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Shank3Q4ACU6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Shank3Q4ACU6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Shank3Q4ACU6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Shank3Q4ACU6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Shank3Q4ACU6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Shank3Q4ACU6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Shank3Q4ACU6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Shank3Q4ACU6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Shank3Q4ACU6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Shank3Q4ACU6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Shank3Q4ACU6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Shank3Q4ACU6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Shank3Q4ACU6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Shank3Q4ACU6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Shank3Q4ACU6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Shank3Q4ACU6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Shank3Q4ACU6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Shank3Q4ACU6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Shank3Q4ACU6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Shank3Q4ACU6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Shank3Q4ACU6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms