Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BC051142Q3V0M8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BC051142Q3V0M8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BC051142Q3V0M8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BC051142Q3V0M8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BC051142Q3V0M8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BC051142Q3V0M8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BC051142Q3V0M8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BC051142Q3V0M8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BC051142Q3V0M8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BC051142Q3V0M8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BC051142Q3V0M8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BC051142Q3V0M8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BC051142Q3V0M8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BC051142Q3V0M8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BC051142Q3V0M8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BC051142Q3V0M8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BC051142Q3V0M8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BC051142Q3V0M8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BC051142Q3V0M8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BC051142Q3V0M8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BC051142Q3V0M8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BC051142Q3V0M8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BC051142Q3V0M8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BC051142Q3V0M8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BC051142Q3V0M8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BC051142Q3V0M8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BC051142Q3V0M8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BC051142Q3V0M8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BC051142Q3V0M8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BC051142Q3V0M8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BC051142Q3V0M8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BC051142Q3V0M8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BC051142Q3V0M8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BC051142Q3V0M8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BC051142Q3V0M8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BC051142Q3V0M8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BC051142Q3V0M8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
BC051142Q3V0M8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BC051142Q3V0M8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BC051142Q3V0M8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BC051142Q3V0M8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BC051142Q3V0M8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BC051142Q3V0M8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BC051142Q3V0M8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BC051142Q3V0M8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BC051142Q3V0M8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BC051142Q3V0M8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BC051142Q3V0M8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC051142Q3V0M8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC051142Q3V0M8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC051142Q3V0M8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC051142Q3V0M8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC051142Q3V0M8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC051142Q3V0M8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BC051142Q3V0M8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BC051142Q3V0M8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BC051142Q3V0M8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BC051142Q3V0M8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BC051142Q3V0M8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BC051142Q3V0M8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BC051142Q3V0M8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BC051142Q3V0M8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms