Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
4930567H17RikQ3V0K5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
4930567H17RikQ3V0K5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
4930567H17RikQ3V0K5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
4930567H17RikQ3V0K5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
4930567H17RikQ3V0K5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
4930567H17RikQ3V0K5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
4930567H17RikQ3V0K5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
4930567H17RikQ3V0K5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
4930567H17RikQ3V0K5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
4930567H17RikQ3V0K5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
4930567H17RikQ3V0K5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
4930567H17RikQ3V0K5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
4930567H17RikQ3V0K5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
4930567H17RikQ3V0K5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
4930567H17RikQ3V0K5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
4930567H17RikQ3V0K5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
4930567H17RikQ3V0K5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
4930567H17RikQ3V0K5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
4930567H17RikQ3V0K5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
4930567H17RikQ3V0K5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
4930567H17RikQ3V0K5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
4930567H17RikQ3V0K5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
4930567H17RikQ3V0K5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
4930567H17RikQ3V0K5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
4930567H17RikQ3V0K5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
4930567H17RikQ3V0K5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
4930567H17RikQ3V0K5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
4930567H17RikQ3V0K5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
4930567H17RikQ3V0K5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
4930567H17RikQ3V0K5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
4930567H17RikQ3V0K5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
4930567H17RikQ3V0K5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
4930567H17RikQ3V0K5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
4930567H17RikQ3V0K5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
4930567H17RikQ3V0K5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
4930567H17RikQ3V0K5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
4930567H17RikQ3V0K5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
4930567H17RikQ3V0K5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
4930567H17RikQ3V0K5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
4930567H17RikQ3V0K5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
4930567H17RikQ3V0K5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
4930567H17RikQ3V0K5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
4930567H17RikQ3V0K5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
4930567H17RikQ3V0K5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
4930567H17RikQ3V0K5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
4930567H17RikQ3V0K5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
4930567H17RikQ3V0K5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
4930567H17RikQ3V0K5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
4930567H17RikQ3V0K5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
4930567H17RikQ3V0K5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
4930567H17RikQ3V0K5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
4930567H17RikQ3V0K5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
4930567H17RikQ3V0K5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
4930567H17RikQ3V0K5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
4930567H17RikQ3V0K5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
4930567H17RikQ3V0K5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
4930567H17RikQ3V0K5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
4930567H17RikQ3V0K5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
4930567H17RikQ3V0K5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
4930567H17RikQ3V0K5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
4930567H17RikQ3V0K5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
4930567H17RikQ3V0K5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
4930567H17RikQ3V0K5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
4930567H17RikQ3V0K5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
4930567H17RikQ3V0K5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
4930567H17RikQ3V0K5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
4930567H17RikQ3V0K5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
4930567H17RikQ3V0K5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
4930567H17RikQ3V0K5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
4930567H17RikQ3V0K5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
4930567H17RikQ3V0K5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
4930567H17RikQ3V0K5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
4930567H17RikQ3V0K5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
4930567H17RikQ3V0K5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
4930567H17RikQ3V0K5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
4930567H17RikQ3V0K5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
4930567H17RikQ3V0K5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
4930567H17RikQ3V0K5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
4930567H17RikQ3V0K5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
4930567H17RikQ3V0K5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
4930567H17RikQ3V0K5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
4930567H17RikQ3V0K5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
4930567H17RikQ3V0K5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
4930567H17RikQ3V0K5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
4930567H17RikQ3V0K5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
4930567H17RikQ3V0K5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
4930567H17RikQ3V0K5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
4930567H17RikQ3V0K5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
4930567H17RikQ3V0K5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
4930567H17RikQ3V0K5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
4930567H17RikQ3V0K5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
4930567H17RikQ3V0K5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
4930567H17RikQ3V0K5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
4930567H17RikQ3V0K5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms