Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C87499Q3UX49 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C87499Q3UX49 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C87499Q3UX49 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C87499Q3UX49 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C87499Q3UX49 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C87499Q3UX49 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C87499Q3UX49 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C87499Q3UX49 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C87499Q3UX49 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C87499Q3UX49 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C87499Q3UX49 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C87499Q3UX49 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C87499Q3UX49 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C87499Q3UX49 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C87499Q3UX49 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C87499Q3UX49 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C87499Q3UX49 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C87499Q3UX49 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C87499Q3UX49 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C87499Q3UX49 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
C87499Q3UX49 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C87499Q3UX49 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C87499Q3UX49 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
C87499Q3UX49 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C87499Q3UX49 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C87499Q3UX49 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C87499Q3UX49 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C87499Q3UX49 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C87499Q3UX49 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C87499Q3UX49 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C87499Q3UX49 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C87499Q3UX49 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C87499Q3UX49 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C87499Q3UX49 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C87499Q3UX49 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C87499Q3UX49 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C87499Q3UX49 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C87499Q3UX49 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C87499Q3UX49 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C87499Q3UX49 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C87499Q3UX49 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C87499Q3UX49 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C87499Q3UX49 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C87499Q3UX49 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C87499Q3UX49 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C87499Q3UX49 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C87499Q3UX49 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C87499Q3UX49 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C87499Q3UX49 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C87499Q3UX49 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C87499Q3UX49 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C87499Q3UX49 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms