Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ7

Prdm10, PR domain zinc finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm10Q3UTQ7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Prdm10Q3UTQ7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Prdm10Q3UTQ7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Prdm10Q3UTQ7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Prdm10Q3UTQ7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Prdm10Q3UTQ7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prdm10Q3UTQ7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prdm10Q3UTQ7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prdm10Q3UTQ7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prdm10Q3UTQ7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prdm10Q3UTQ7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Prdm10Q3UTQ7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Prdm10Q3UTQ7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Prdm10Q3UTQ7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Prdm10Q3UTQ7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Prdm10Q3UTQ7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Prdm10Q3UTQ7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Prdm10Q3UTQ7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prdm10Q3UTQ7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prdm10Q3UTQ7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prdm10Q3UTQ7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prdm10Q3UTQ7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prdm10Q3UTQ7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prdm10Q3UTQ7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prdm10Q3UTQ7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prdm10Q3UTQ7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prdm10Q3UTQ7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prdm10Q3UTQ7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prdm10Q3UTQ7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prdm10Q3UTQ7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prdm10Q3UTQ7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Prdm10Q3UTQ7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Prdm10Q3UTQ7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Prdm10Q3UTQ7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Prdm10Q3UTQ7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Prdm10Q3UTQ7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Prdm10Q3UTQ7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Prdm10Q3UTQ7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Prdm10Q3UTQ7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Prdm10Q3UTQ7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Prdm10Q3UTQ7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Prdm10Q3UTQ7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Prdm10Q3UTQ7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Prdm10Q3UTQ7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Prdm10Q3UTQ7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Prdm10Q3UTQ7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Prdm10Q3UTQ7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Prdm10Q3UTQ7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Prdm10Q3UTQ7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Prdm10Q3UTQ7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Prdm10Q3UTQ7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Prdm10Q3UTQ7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Prdm10Q3UTQ7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prdm10Q3UTQ7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prdm10Q3UTQ7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prdm10Q3UTQ7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prdm10Q3UTQ7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prdm10Q3UTQ7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prdm10Q3UTQ7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prdm10Q3UTQ7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Prdm10Q3UTQ7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Prdm10Q3UTQ7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Prdm10Q3UTQ7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Prdm10Q3UTQ7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Prdm10Q3UTQ7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Prdm10Q3UTQ7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Prdm10Q3UTQ7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Prdm10Q3UTQ7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Prdm10Q3UTQ7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Prdm10Q3UTQ7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prdm10Q3UTQ7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prdm10Q3UTQ7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prdm10Q3UTQ7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Prdm10Q3UTQ7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prdm10Q3UTQ7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prdm10Q3UTQ7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Prdm10Q3UTQ7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prdm10Q3UTQ7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prdm10Q3UTQ7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prdm10Q3UTQ7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prdm10Q3UTQ7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Prdm10Q3UTQ7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Prdm10Q3UTQ7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prdm10Q3UTQ7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prdm10Q3UTQ7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prdm10Q3UTQ7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Prdm10Q3UTQ7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prdm10Q3UTQ7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prdm10Q3UTQ7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prdm10Q3UTQ7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prdm10Q3UTQ7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prdm10Q3UTQ7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prdm10Q3UTQ7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Prdm10Q3UTQ7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prdm10Q3UTQ7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prdm10Q3UTQ7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Prdm10Q3UTQ7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prdm10Q3UTQ7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Prdm10Q3UTQ7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prdm10Q3UTQ7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms