Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam35aQ3UEN2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam35aQ3UEN2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam35aQ3UEN2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam35aQ3UEN2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam35aQ3UEN2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam35aQ3UEN2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam35aQ3UEN2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam35aQ3UEN2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam35aQ3UEN2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam35aQ3UEN2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam35aQ3UEN2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam35aQ3UEN2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam35aQ3UEN2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam35aQ3UEN2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam35aQ3UEN2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam35aQ3UEN2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam35aQ3UEN2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam35aQ3UEN2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam35aQ3UEN2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam35aQ3UEN2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam35aQ3UEN2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam35aQ3UEN2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam35aQ3UEN2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam35aQ3UEN2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam35aQ3UEN2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam35aQ3UEN2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam35aQ3UEN2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam35aQ3UEN2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam35aQ3UEN2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam35aQ3UEN2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fam35aQ3UEN2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam35aQ3UEN2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam35aQ3UEN2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam35aQ3UEN2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam35aQ3UEN2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam35aQ3UEN2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam35aQ3UEN2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam35aQ3UEN2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam35aQ3UEN2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam35aQ3UEN2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam35aQ3UEN2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam35aQ3UEN2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam35aQ3UEN2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam35aQ3UEN2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam35aQ3UEN2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam35aQ3UEN2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam35aQ3UEN2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam35aQ3UEN2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms