Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brf2Q3UAW9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brf2Q3UAW9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brf2Q3UAW9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brf2Q3UAW9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brf2Q3UAW9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brf2Q3UAW9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brf2Q3UAW9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brf2Q3UAW9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brf2Q3UAW9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brf2Q3UAW9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brf2Q3UAW9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brf2Q3UAW9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brf2Q3UAW9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brf2Q3UAW9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Brf2Q3UAW9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brf2Q3UAW9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brf2Q3UAW9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brf2Q3UAW9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brf2Q3UAW9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brf2Q3UAW9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brf2Q3UAW9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Brf2Q3UAW9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Brf2Q3UAW9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brf2Q3UAW9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brf2Q3UAW9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Brf2Q3UAW9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Brf2Q3UAW9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brf2Q3UAW9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brf2Q3UAW9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brf2Q3UAW9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brf2Q3UAW9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brf2Q3UAW9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brf2Q3UAW9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brf2Q3UAW9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brf2Q3UAW9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brf2Q3UAW9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brf2Q3UAW9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brf2Q3UAW9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brf2Q3UAW9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brf2Q3UAW9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Brf2Q3UAW9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Brf2Q3UAW9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Brf2Q3UAW9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Brf2Q3UAW9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Brf2Q3UAW9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brf2Q3UAW9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brf2Q3UAW9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brf2Q3UAW9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms