Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V1

Khsrp, Far upstream element-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KhsrpQ3U0V1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KhsrpQ3U0V1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KhsrpQ3U0V1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KhsrpQ3U0V1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KhsrpQ3U0V1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KhsrpQ3U0V1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KhsrpQ3U0V1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KhsrpQ3U0V1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KhsrpQ3U0V1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KhsrpQ3U0V1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KhsrpQ3U0V1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KhsrpQ3U0V1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KhsrpQ3U0V1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KhsrpQ3U0V1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KhsrpQ3U0V1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KhsrpQ3U0V1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KhsrpQ3U0V1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KhsrpQ3U0V1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KhsrpQ3U0V1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KhsrpQ3U0V1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KhsrpQ3U0V1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KhsrpQ3U0V1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KhsrpQ3U0V1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KhsrpQ3U0V1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KhsrpQ3U0V1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KhsrpQ3U0V1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KhsrpQ3U0V1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KhsrpQ3U0V1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KhsrpQ3U0V1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KhsrpQ3U0V1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KhsrpQ3U0V1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KhsrpQ3U0V1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KhsrpQ3U0V1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KhsrpQ3U0V1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KhsrpQ3U0V1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KhsrpQ3U0V1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KhsrpQ3U0V1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KhsrpQ3U0V1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KhsrpQ3U0V1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KhsrpQ3U0V1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KhsrpQ3U0V1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KhsrpQ3U0V1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KhsrpQ3U0V1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KhsrpQ3U0V1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KhsrpQ3U0V1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KhsrpQ3U0V1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KhsrpQ3U0V1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KhsrpQ3U0V1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KhsrpQ3U0V1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KhsrpQ3U0V1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KhsrpQ3U0V1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KhsrpQ3U0V1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KhsrpQ3U0V1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KhsrpQ3U0V1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KhsrpQ3U0V1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms