Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hhla1Q3TYV2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hhla1Q3TYV2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hhla1Q3TYV2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hhla1Q3TYV2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hhla1Q3TYV2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hhla1Q3TYV2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hhla1Q3TYV2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hhla1Q3TYV2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hhla1Q3TYV2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hhla1Q3TYV2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms