Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CiartQ3TQ03 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CiartQ3TQ03 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CiartQ3TQ03 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CiartQ3TQ03 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CiartQ3TQ03 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CiartQ3TQ03 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CiartQ3TQ03 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CiartQ3TQ03 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CiartQ3TQ03 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CiartQ3TQ03 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CiartQ3TQ03 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CiartQ3TQ03 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CiartQ3TQ03 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CiartQ3TQ03 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CiartQ3TQ03 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CiartQ3TQ03 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CiartQ3TQ03 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CiartQ3TQ03 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CiartQ3TQ03 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CiartQ3TQ03 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CiartQ3TQ03 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CiartQ3TQ03 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CiartQ3TQ03 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CiartQ3TQ03 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CiartQ3TQ03 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CiartQ3TQ03 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CiartQ3TQ03 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CiartQ3TQ03 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CiartQ3TQ03 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CiartQ3TQ03 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CiartQ3TQ03 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CiartQ3TQ03 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CiartQ3TQ03 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CiartQ3TQ03 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CiartQ3TQ03 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CiartQ3TQ03 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CiartQ3TQ03 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CiartQ3TQ03 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CiartQ3TQ03 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CiartQ3TQ03 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CiartQ3TQ03 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CiartQ3TQ03 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CiartQ3TQ03 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CiartQ3TQ03 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CiartQ3TQ03 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CiartQ3TQ03 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CiartQ3TQ03 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CiartQ3TQ03 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CiartQ3TQ03 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CiartQ3TQ03 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CiartQ3TQ03 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CiartQ3TQ03 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms