Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNH5

Fam172a, Protein FAM172A, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam172aQ3TNH5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam172aQ3TNH5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam172aQ3TNH5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam172aQ3TNH5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam172aQ3TNH5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam172aQ3TNH5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam172aQ3TNH5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam172aQ3TNH5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam172aQ3TNH5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam172aQ3TNH5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam172aQ3TNH5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam172aQ3TNH5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam172aQ3TNH5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam172aQ3TNH5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam172aQ3TNH5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam172aQ3TNH5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam172aQ3TNH5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam172aQ3TNH5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam172aQ3TNH5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam172aQ3TNH5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam172aQ3TNH5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam172aQ3TNH5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam172aQ3TNH5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam172aQ3TNH5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam172aQ3TNH5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam172aQ3TNH5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam172aQ3TNH5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam172aQ3TNH5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam172aQ3TNH5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam172aQ3TNH5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam172aQ3TNH5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam172aQ3TNH5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam172aQ3TNH5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam172aQ3TNH5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam172aQ3TNH5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam172aQ3TNH5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam172aQ3TNH5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam172aQ3TNH5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam172aQ3TNH5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam172aQ3TNH5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam172aQ3TNH5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam172aQ3TNH5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam172aQ3TNH5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam172aQ3TNH5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam172aQ3TNH5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam172aQ3TNH5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam172aQ3TNH5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam172aQ3TNH5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam172aQ3TNH5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam172aQ3TNH5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam172aQ3TNH5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam172aQ3TNH5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam172aQ3TNH5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam172aQ3TNH5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam172aQ3TNH5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam172aQ3TNH5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam172aQ3TNH5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam172aQ3TNH5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam172aQ3TNH5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam172aQ3TNH5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam172aQ3TNH5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam172aQ3TNH5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam172aQ3TNH5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam172aQ3TNH5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam172aQ3TNH5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam172aQ3TNH5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam172aQ3TNH5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam172aQ3TNH5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam172aQ3TNH5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam172aQ3TNH5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam172aQ3TNH5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam172aQ3TNH5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam172aQ3TNH5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam172aQ3TNH5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam172aQ3TNH5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam172aQ3TNH5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam172aQ3TNH5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam172aQ3TNH5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam172aQ3TNH5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam172aQ3TNH5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam172aQ3TNH5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam172aQ3TNH5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam172aQ3TNH5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam172aQ3TNH5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam172aQ3TNH5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam172aQ3TNH5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam172aQ3TNH5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam172aQ3TNH5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam172aQ3TNH5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam172aQ3TNH5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam172aQ3TNH5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam172aQ3TNH5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam172aQ3TNH5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam172aQ3TNH5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam172aQ3TNH5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam172aQ3TNH5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam172aQ3TNH5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam172aQ3TNH5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam172aQ3TNH5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam172aQ3TNH5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms