Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdlim7Q3TJD7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdlim7Q3TJD7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdlim7Q3TJD7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdlim7Q3TJD7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdlim7Q3TJD7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdlim7Q3TJD7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdlim7Q3TJD7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdlim7Q3TJD7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdlim7Q3TJD7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdlim7Q3TJD7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdlim7Q3TJD7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdlim7Q3TJD7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdlim7Q3TJD7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdlim7Q3TJD7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdlim7Q3TJD7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdlim7Q3TJD7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdlim7Q3TJD7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdlim7Q3TJD7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdlim7Q3TJD7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdlim7Q3TJD7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdlim7Q3TJD7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdlim7Q3TJD7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdlim7Q3TJD7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdlim7Q3TJD7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdlim7Q3TJD7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdlim7Q3TJD7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdlim7Q3TJD7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdlim7Q3TJD7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdlim7Q3TJD7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdlim7Q3TJD7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdlim7Q3TJD7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdlim7Q3TJD7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdlim7Q3TJD7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdlim7Q3TJD7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdlim7Q3TJD7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdlim7Q3TJD7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdlim7Q3TJD7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdlim7Q3TJD7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdlim7Q3TJD7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdlim7Q3TJD7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdlim7Q3TJD7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdlim7Q3TJD7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdlim7Q3TJD7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdlim7Q3TJD7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdlim7Q3TJD7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdlim7Q3TJD7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdlim7Q3TJD7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdlim7Q3TJD7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdlim7Q3TJD7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdlim7Q3TJD7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdlim7Q3TJD7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdlim7Q3TJD7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdlim7Q3TJD7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdlim7Q3TJD7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdlim7Q3TJD7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdlim7Q3TJD7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pdlim7Q3TJD7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pdlim7Q3TJD7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdlim7Q3TJD7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdlim7Q3TJD7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdlim7Q3TJD7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdlim7Q3TJD7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdlim7Q3TJD7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdlim7Q3TJD7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdlim7Q3TJD7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdlim7Q3TJD7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdlim7Q3TJD7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdlim7Q3TJD7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdlim7Q3TJD7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdlim7Q3TJD7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdlim7Q3TJD7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdlim7Q3TJD7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdlim7Q3TJD7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdlim7Q3TJD7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdlim7Q3TJD7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdlim7Q3TJD7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdlim7Q3TJD7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdlim7Q3TJD7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdlim7Q3TJD7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdlim7Q3TJD7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdlim7Q3TJD7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdlim7Q3TJD7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pdlim7Q3TJD7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pdlim7Q3TJD7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pdlim7Q3TJD7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pdlim7Q3TJD7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Pdlim7Q3TJD7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Pdlim7Q3TJD7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Pdlim7Q3TJD7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pdlim7Q3TJD7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdlim7Q3TJD7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdlim7Q3TJD7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdlim7Q3TJD7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdlim7Q3TJD7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdlim7Q3TJD7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdlim7Q3TJD7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdlim7Q3TJD7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdlim7Q3TJD7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdlim7Q3TJD7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms