Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX6

Fubp3, Far upstream element (FUSE)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp3Q3TIX6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Fubp3Q3TIX6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fubp3Q3TIX6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fubp3Q3TIX6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fubp3Q3TIX6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fubp3Q3TIX6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fubp3Q3TIX6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fubp3Q3TIX6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fubp3Q3TIX6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fubp3Q3TIX6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fubp3Q3TIX6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fubp3Q3TIX6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fubp3Q3TIX6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fubp3Q3TIX6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fubp3Q3TIX6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fubp3Q3TIX6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Fubp3Q3TIX6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fubp3Q3TIX6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Fubp3Q3TIX6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fubp3Q3TIX6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fubp3Q3TIX6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fubp3Q3TIX6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fubp3Q3TIX6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fubp3Q3TIX6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fubp3Q3TIX6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fubp3Q3TIX6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fubp3Q3TIX6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fubp3Q3TIX6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fubp3Q3TIX6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fubp3Q3TIX6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fubp3Q3TIX6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fubp3Q3TIX6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fubp3Q3TIX6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fubp3Q3TIX6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fubp3Q3TIX6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fubp3Q3TIX6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fubp3Q3TIX6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fubp3Q3TIX6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fubp3Q3TIX6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fubp3Q3TIX6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fubp3Q3TIX6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fubp3Q3TIX6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fubp3Q3TIX6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fubp3Q3TIX6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Fubp3Q3TIX6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fubp3Q3TIX6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fubp3Q3TIX6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fubp3Q3TIX6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fubp3Q3TIX6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fubp3Q3TIX6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fubp3Q3TIX6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fubp3Q3TIX6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fubp3Q3TIX6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fubp3Q3TIX6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fubp3Q3TIX6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fubp3Q3TIX6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fubp3Q3TIX6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fubp3Q3TIX6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms