Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Riiad1Q3KNY5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Riiad1Q3KNY5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Riiad1Q3KNY5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Riiad1Q3KNY5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Riiad1Q3KNY5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Riiad1Q3KNY5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Riiad1Q3KNY5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Riiad1Q3KNY5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Riiad1Q3KNY5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Riiad1Q3KNY5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Riiad1Q3KNY5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Riiad1Q3KNY5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Riiad1Q3KNY5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Riiad1Q3KNY5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Riiad1Q3KNY5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Riiad1Q3KNY5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Riiad1Q3KNY5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Riiad1Q3KNY5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Riiad1Q3KNY5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Riiad1Q3KNY5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Riiad1Q3KNY5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Riiad1Q3KNY5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Riiad1Q3KNY5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Riiad1Q3KNY5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Riiad1Q3KNY5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Riiad1Q3KNY5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Riiad1Q3KNY5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Riiad1Q3KNY5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Riiad1Q3KNY5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Riiad1Q3KNY5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Riiad1Q3KNY5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Riiad1Q3KNY5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Riiad1Q3KNY5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Riiad1Q3KNY5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Riiad1Q3KNY5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Riiad1Q3KNY5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Riiad1Q3KNY5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Riiad1Q3KNY5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Riiad1Q3KNY5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Riiad1Q3KNY5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Riiad1Q3KNY5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Riiad1Q3KNY5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Riiad1Q3KNY5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Riiad1Q3KNY5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Riiad1Q3KNY5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Riiad1Q3KNY5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Riiad1Q3KNY5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Riiad1Q3KNY5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Riiad1Q3KNY5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Riiad1Q3KNY5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Riiad1Q3KNY5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms