Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRFIP1Q32MZ4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRFIP1Q32MZ4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRFIP1Q32MZ4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LRRFIP1Q32MZ4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRFIP1Q32MZ4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRFIP1Q32MZ4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRFIP1Q32MZ4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRFIP1Q32MZ4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRFIP1Q32MZ4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRFIP1Q32MZ4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRFIP1Q32MZ4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRFIP1Q32MZ4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRFIP1Q32MZ4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRFIP1Q32MZ4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRFIP1Q32MZ4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRFIP1Q32MZ4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRFIP1Q32MZ4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRFIP1Q32MZ4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRFIP1Q32MZ4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRFIP1Q32MZ4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRFIP1Q32MZ4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRFIP1Q32MZ4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRFIP1Q32MZ4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRFIP1Q32MZ4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRFIP1Q32MZ4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRFIP1Q32MZ4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRFIP1Q32MZ4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRFIP1Q32MZ4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRFIP1Q32MZ4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRFIP1Q32MZ4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRFIP1Q32MZ4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRFIP1Q32MZ4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRFIP1Q32MZ4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRFIP1Q32MZ4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRFIP1Q32MZ4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRFIP1Q32MZ4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRFIP1Q32MZ4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRFIP1Q32MZ4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRFIP1Q32MZ4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRFIP1Q32MZ4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRFIP1Q32MZ4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
LRRFIP1Q32MZ4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
LRRFIP1Q32MZ4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRFIP1Q32MZ4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRFIP1Q32MZ4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRFIP1Q32MZ4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRFIP1Q32MZ4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRFIP1Q32MZ4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRFIP1Q32MZ4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRFIP1Q32MZ4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRFIP1Q32MZ4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRFIP1Q32MZ4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRFIP1Q32MZ4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRFIP1Q32MZ4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRFIP1Q32MZ4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRFIP1Q32MZ4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRFIP1Q32MZ4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRFIP1Q32MZ4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRFIP1Q32MZ4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRFIP1Q32MZ4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRFIP1Q32MZ4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRFIP1Q32MZ4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRFIP1Q32MZ4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRFIP1Q32MZ4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRFIP1Q32MZ4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRFIP1Q32MZ4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRFIP1Q32MZ4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRFIP1Q32MZ4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRFIP1Q32MZ4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRFIP1Q32MZ4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms