Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MICAQ29983 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MICAQ29983 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MICAQ29983 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MICAQ29983 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MICAQ29983 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MICAQ29983 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MICAQ29983 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MICAQ29983 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MICAQ29983 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MICAQ29983 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MICAQ29983 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MICAQ29983 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MICAQ29983 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MICAQ29983 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MICAQ29983 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MICAQ29983 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MICAQ29983 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MICAQ29983 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MICAQ29983 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MICAQ29983 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MICAQ29983 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MICAQ29983 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MICAQ29983 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MICAQ29983 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MICAQ29983 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MICAQ29983 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MICAQ29983 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MICAQ29983 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MICAQ29983 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MICAQ29983 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MICAQ29983 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MICAQ29983 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MICAQ29983 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MICAQ29983 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MICAQ29983 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MICAQ29983 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MICAQ29983 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MICAQ29983 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MICAQ29983 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MICAQ29983 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MICAQ29983 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MICAQ29983 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MICAQ29983 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MICAQ29983 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MICAQ29983 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MICAQ29983 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MICAQ29983 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MICAQ29983 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MICAQ29983 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MICAQ29983 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MICAQ29983 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MICAQ29983 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MICAQ29983 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MICAQ29983 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MICAQ29983 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MICAQ29983 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MICAQ29983 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MICAQ29983 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MICAQ29983 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MICAQ29983 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MICAQ29983 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MICAQ29983 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MICAQ29983 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MICAQ29983 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MICAQ29983 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MICAQ29983 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MICAQ29983 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MICAQ29983 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MICAQ29983 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MICAQ29983 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MICAQ29983 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MICAQ29983 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MICAQ29983 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MICAQ29983 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MICAQ29983 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MICAQ29983 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MICAQ29983 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MICAQ29983 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MICAQ29983 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MICAQ29983 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MICAQ29983 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MICAQ29983 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MICAQ29983 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MICAQ29983 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MICAQ29983 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MICAQ29983 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MICAQ29983 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MICAQ29983 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MICAQ29983 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MICAQ29983 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MICAQ29983 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MICAQ29983 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MICAQ29983 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MICAQ29983 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MICAQ29983 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MICAQ29983 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MICAQ29983 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MICAQ29983 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MICAQ29983 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms