Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NRF1Q16656 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
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NRF1Q16656 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRF1Q16656 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRF1Q16656 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRF1Q16656 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRF1Q16656 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRF1Q16656 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
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NRF1Q16656 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
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NRF1Q16656 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRF1Q16656 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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NRF1Q16656 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRF1Q16656 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NRF1Q16656 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NRF1Q16656 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
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NRF1Q16656 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NRF1Q16656 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRF1Q16656 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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