Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC18A3Q16572 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC18A3Q16572 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
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