Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC85BQ15834 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC85BQ15834 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC85BQ15834 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC85BQ15834 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC85BQ15834 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC85BQ15834 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC85BQ15834 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC85BQ15834 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC85BQ15834 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC85BQ15834 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC85BQ15834 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC85BQ15834 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC85BQ15834 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC85BQ15834 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC85BQ15834 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC85BQ15834 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC85BQ15834 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC85BQ15834 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC85BQ15834 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC85BQ15834 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC85BQ15834 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC85BQ15834 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC85BQ15834 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC85BQ15834 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC85BQ15834 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC85BQ15834 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC85BQ15834 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC85BQ15834 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC85BQ15834 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC85BQ15834 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC85BQ15834 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC85BQ15834 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC85BQ15834 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC85BQ15834 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC85BQ15834 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC85BQ15834 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
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