Protein–RNA interactions for Protein: Q15653

NFKBIB, NF-kappa-B inhibitor beta, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIBQ15653 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NFKBIBQ15653 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NFKBIBQ15653 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms