Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NKX1-1Q15270 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NKX1-1Q15270 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NKX1-1Q15270 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NKX1-1Q15270 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
NKX1-1Q15270 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NKX1-1Q15270 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NKX1-1Q15270 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
NKX1-1Q15270 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
NKX1-1Q15270 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NKX1-1Q15270 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NKX1-1Q15270 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NKX1-1Q15270 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NKX1-1Q15270 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NKX1-1Q15270 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
NKX1-1Q15270 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NKX1-1Q15270 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NKX1-1Q15270 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NKX1-1Q15270 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NKX1-1Q15270 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NKX1-1Q15270 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
NKX1-1Q15270 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NKX1-1Q15270 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NKX1-1Q15270 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NKX1-1Q15270 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NKX1-1Q15270 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NKX1-1Q15270 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NKX1-1Q15270 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NKX1-1Q15270 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NKX1-1Q15270 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NKX1-1Q15270 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NKX1-1Q15270 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
NKX1-1Q15270 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NKX1-1Q15270 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NKX1-1Q15270 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NKX1-1Q15270 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
NKX1-1Q15270 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NKX1-1Q15270 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NKX1-1Q15270 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NKX1-1Q15270 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NKX1-1Q15270 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NKX1-1Q15270 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NKX1-1Q15270 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NKX1-1Q15270 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NKX1-1Q15270 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NKX1-1Q15270 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
NKX1-1Q15270 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NKX1-1Q15270 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NKX1-1Q15270 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NKX1-1Q15270 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
NKX1-1Q15270 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NKX1-1Q15270 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
NKX1-1Q15270 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NKX1-1Q15270 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NKX1-1Q15270 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
NKX1-1Q15270 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
NKX1-1Q15270 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NKX1-1Q15270 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NKX1-1Q15270 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NKX1-1Q15270 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NKX1-1Q15270 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
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