Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PTPRKQ15262 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PTPRKQ15262 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PTPRKQ15262 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PTPRKQ15262 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PTPRKQ15262 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PTPRKQ15262 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PTPRKQ15262 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PTPRKQ15262 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PTPRKQ15262 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PTPRKQ15262 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PTPRKQ15262 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PTPRKQ15262 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PTPRKQ15262 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PTPRKQ15262 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PTPRKQ15262 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PTPRKQ15262 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PTPRKQ15262 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PTPRKQ15262 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PTPRKQ15262 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PTPRKQ15262 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PTPRKQ15262 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PTPRKQ15262 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PTPRKQ15262 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PTPRKQ15262 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PTPRKQ15262 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PTPRKQ15262 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PTPRKQ15262 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PTPRKQ15262 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PTPRKQ15262 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PTPRKQ15262 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
PTPRKQ15262 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PTPRKQ15262 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PTPRKQ15262 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PTPRKQ15262 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PTPRKQ15262 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
PTPRKQ15262 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
PTPRKQ15262 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PTPRKQ15262 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PTPRKQ15262 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PTPRKQ15262 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PTPRKQ15262 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PTPRKQ15262 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PTPRKQ15262 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PTPRKQ15262 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PTPRKQ15262 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PTPRKQ15262 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PTPRKQ15262 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PTPRKQ15262 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PTPRKQ15262 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PTPRKQ15262 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PTPRKQ15262 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PTPRKQ15262 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
PTPRKQ15262 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PTPRKQ15262 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PTPRKQ15262 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PTPRKQ15262 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PTPRKQ15262 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PTPRKQ15262 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PTPRKQ15262 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PTPRKQ15262 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
PTPRKQ15262 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PTPRKQ15262 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
PTPRKQ15262 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
PTPRKQ15262 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PTPRKQ15262 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PTPRKQ15262 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PTPRKQ15262 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PTPRKQ15262 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PTPRKQ15262 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PTPRKQ15262 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PTPRKQ15262 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PTPRKQ15262 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PTPRKQ15262 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PTPRKQ15262 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PTPRKQ15262 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PTPRKQ15262 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PTPRKQ15262 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PTPRKQ15262 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
PTPRKQ15262 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PTPRKQ15262 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PTPRKQ15262 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PTPRKQ15262 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PTPRKQ15262 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PTPRKQ15262 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PTPRKQ15262 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PTPRKQ15262 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PTPRKQ15262 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PTPRKQ15262 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PTPRKQ15262 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
PTPRKQ15262 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PTPRKQ15262 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PTPRKQ15262 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PTPRKQ15262 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PTPRKQ15262 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PTPRKQ15262 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PTPRKQ15262 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PTPRKQ15262 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
PTPRKQ15262 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PTPRKQ15262 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
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