Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BRD3Q15059 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
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