Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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ptchd1Q14B62 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ptchd1Q14B62 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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ptchd1Q14B62 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ptchd1Q14B62 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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ptchd1Q14B62 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ptchd1Q14B62 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ptchd1Q14B62 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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ptchd1Q14B62 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ptchd1Q14B62 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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ptchd1Q14B62 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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ptchd1Q14B62 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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ptchd1Q14B62 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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ptchd1Q14B62 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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ptchd1Q14B62 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ptchd1Q14B62 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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ptchd1Q14B62 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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ptchd1Q14B62 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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