Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAPRIN1Q14444 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPRIN1Q14444 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPRIN1Q14444 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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