Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNX2Q13950 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUNX2Q13950 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNX2Q13950 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNX2Q13950 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNX2Q13950 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNX2Q13950 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNX2Q13950 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNX2Q13950 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNX2Q13950 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNX2Q13950 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNX2Q13950 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNX2Q13950 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNX2Q13950 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNX2Q13950 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNX2Q13950 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNX2Q13950 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNX2Q13950 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNX2Q13950 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNX2Q13950 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNX2Q13950 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNX2Q13950 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNX2Q13950 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNX2Q13950 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNX2Q13950 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNX2Q13950 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNX2Q13950 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms