Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGCGQ13326 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGCGQ13326 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGCGQ13326 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGCGQ13326 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGCGQ13326 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGCGQ13326 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGCGQ13326 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGCGQ13326 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGCGQ13326 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGCGQ13326 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGCGQ13326 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGCGQ13326 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGCGQ13326 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGCGQ13326 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGCGQ13326 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SGCGQ13326 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGCGQ13326 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGCGQ13326 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGCGQ13326 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGCGQ13326 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGCGQ13326 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGCGQ13326 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGCGQ13326 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGCGQ13326 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGCGQ13326 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGCGQ13326 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGCGQ13326 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGCGQ13326 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGCGQ13326 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGCGQ13326 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGCGQ13326 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGCGQ13326 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGCGQ13326 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
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