Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRJQ12913 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRJQ12913 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRJQ12913 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRJQ12913 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRJQ12913 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRJQ12913 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRJQ12913 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRJQ12913 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRJQ12913 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRJQ12913 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRJQ12913 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRJQ12913 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRJQ12913 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRJQ12913 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRJQ12913 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRJQ12913 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRJQ12913 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRJQ12913 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRJQ12913 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRJQ12913 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRJQ12913 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRJQ12913 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRJQ12913 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRJQ12913 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRJQ12913 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRJQ12913 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRJQ12913 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
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PTPRJQ12913 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRJQ12913 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
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PTPRJQ12913 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRJQ12913 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRJQ12913 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRJQ12913 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
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PTPRJQ12913 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRJQ12913 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRJQ12913 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRJQ12913 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRJQ12913 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRJQ12913 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRJQ12913 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRJQ12913 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRJQ12913 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRJQ12913 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRJQ12913 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRJQ12913 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRJQ12913 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRJQ12913 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRJQ12913 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRJQ12913 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRJQ12913 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRJQ12913 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRJQ12913 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRJQ12913 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRJQ12913 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRJQ12913 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRJQ12913 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRJQ12913 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRJQ12913 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRJQ12913 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRJQ12913 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRJQ12913 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRJQ12913 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRJQ12913 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRJQ12913 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRJQ12913 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
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