Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TP53BP1Q12888 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TP53BP1Q12888 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TP53BP1Q12888 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TP53BP1Q12888 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
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