Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
HMGXB3Q12766 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
HMGXB3Q12766 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
HMGXB3Q12766 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
HMGXB3Q12766 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
HMGXB3Q12766 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
HMGXB3Q12766 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
HMGXB3Q12766 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC42.89■■■■■ 4.46
HMGXB3Q12766 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC42.89■■■■■ 4.46
HMGXB3Q12766 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
HMGXB3Q12766 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
HMGXB3Q12766 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
HMGXB3Q12766 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
HMGXB3Q12766 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
HMGXB3Q12766 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
HMGXB3Q12766 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
HMGXB3Q12766 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
HMGXB3Q12766 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
HMGXB3Q12766 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
HMGXB3Q12766 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
HMGXB3Q12766 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
HMGXB3Q12766 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC42.84■■■■■ 4.45
HMGXB3Q12766 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC42.84■■■■■ 4.45
HMGXB3Q12766 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC42.84■■■■■ 4.45
HMGXB3Q12766 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC42.83■■■■■ 4.45
HMGXB3Q12766 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.82■■■■■ 4.45
HMGXB3Q12766 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
HMGXB3Q12766 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
HMGXB3Q12766 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.82■■■■■ 4.45
HMGXB3Q12766 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
HMGXB3Q12766 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
HMGXB3Q12766 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
HMGXB3Q12766 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
HMGXB3Q12766 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
HMGXB3Q12766 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
HMGXB3Q12766 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
HMGXB3Q12766 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC42.81■■■■■ 4.44
HMGXB3Q12766 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
HMGXB3Q12766 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
HMGXB3Q12766 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
HMGXB3Q12766 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
HMGXB3Q12766 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
HMGXB3Q12766 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.8■■■■■ 4.44
HMGXB3Q12766 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
HMGXB3Q12766 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
HMGXB3Q12766 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC42.78■■■■■ 4.44
HMGXB3Q12766 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
HMGXB3Q12766 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
HMGXB3Q12766 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC42.77■■■■■ 4.44
HMGXB3Q12766 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.77■■■■■ 4.44
HMGXB3Q12766 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC42.76■■■■■ 4.44
HMGXB3Q12766 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
HMGXB3Q12766 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC42.74■■■■■ 4.43
HMGXB3Q12766 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
HMGXB3Q12766 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
HMGXB3Q12766 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC42.73■■■■■ 4.43
HMGXB3Q12766 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC42.73■■■■■ 4.43
HMGXB3Q12766 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
HMGXB3Q12766 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
HMGXB3Q12766 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
HMGXB3Q12766 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
HMGXB3Q12766 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
HMGXB3Q12766 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.7■■■■■ 4.43
HMGXB3Q12766 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC42.7■■■■■ 4.43
HMGXB3Q12766 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.7■■■■■ 4.43
HMGXB3Q12766 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
HMGXB3Q12766 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.42
HMGXB3Q12766 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
HMGXB3Q12766 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC42.69■■■■■ 4.42
HMGXB3Q12766 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC42.69■■■■■ 4.42
HMGXB3Q12766 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
HMGXB3Q12766 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC42.68■■■■■ 4.42
HMGXB3Q12766 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC42.68■■■■■ 4.42
HMGXB3Q12766 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
HMGXB3Q12766 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
HMGXB3Q12766 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC42.66■■■■■ 4.42
HMGXB3Q12766 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
HMGXB3Q12766 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC42.66■■■■■ 4.42
HMGXB3Q12766 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC42.65■■■■■ 4.42
HMGXB3Q12766 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
HMGXB3Q12766 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
HMGXB3Q12766 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC42.65■■■■■ 4.42
HMGXB3Q12766 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC42.64■■■■■ 4.42
HMGXB3Q12766 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
HMGXB3Q12766 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
HMGXB3Q12766 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC42.63■■■■■ 4.42
HMGXB3Q12766 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
HMGXB3Q12766 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
HMGXB3Q12766 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC42.62■■■■■ 4.41
HMGXB3Q12766 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.62■■■■■ 4.41
HMGXB3Q12766 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
HMGXB3Q12766 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
HMGXB3Q12766 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
HMGXB3Q12766 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC42.61■■■■■ 4.41
HMGXB3Q12766 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC42.61■■■■■ 4.41
HMGXB3Q12766 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
HMGXB3Q12766 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
HMGXB3Q12766 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC42.59■■■■■ 4.41
HMGXB3Q12766 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
HMGXB3Q12766 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms