Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 YIP5YGL161C 933 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 PFS1YHR185C 714 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 NYV1YLR093C 762 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 AIM36YMR157C 768 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 PRS4YBL068W 981 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 MUD1YBR119W 897 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 GAL3YDR009W 1563 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 HXT7YDR342C 1713 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 HXT6YDR343C 1713 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 VPS36YLR417W 1701 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 OPT1YJL212C 2400 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 YKR018CYKR018C 2178 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 PMT1YDL095W 2454 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 FDC1YDR539W 1512 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 SNF11YDR073W 510 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 CAB5YDR196C 726 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 MPO1YGL010W 525 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 DSD1YGL196W 1287 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 MRPL4YLR439W 960 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 TOM7YNL070W 183 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 HNT3YOR258W 654 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 YPL102CYPL102C 303 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 ENV7YPL236C 1095 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 YNR066CYNR066C 1311 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 YRF1-3YGR296W 5580 nt6.96□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 YRF1-6YNL339C 5580 nt6.96□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 YRF1-7YPL283C 5580 nt6.96□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 ICL2YPR006C 1728 nt6.96□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 PTC1YDL006W 846 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 SBP1YHL034C 885 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 CBF1YJR060W 1056 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 MIC27YNL100W 705 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 CSI2YOL007C 1026 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 SUR1YPL057C 1149 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 LRO1YNR008W 1986 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 TFC6YDR362C 2019 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 YBL111CYBL111C 2004 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 EUG1YDR518W 1554 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 TGL1YKL140W 1647 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 POX1YGL205W 2247 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 HMLALPHA2YCL067C 633 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 MATALPHA2YCR039C 633 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 YLL037WYLL037W 381 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 YBL029WYBL029W 1131 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 SUB1YMR039C 879 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 TPT1YOL102C 693 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 GSP2YOR185C 663 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 MEP1YGR121C 1479 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 NSE4YDL105W 1209 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 NRG1YDR043C 696 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 SPR28YDR218C 1272 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 RNH202YDR279W 1053 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 CAB1YDR531W 1104 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 UPF3YGR072W 1164 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 RSR1YGR152C 819 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 AIM18YHR198C 966 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 NSE1YLR007W 1011 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 SML1YML058W 315 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 RCL1YOL010W 1104 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 YOR105WYOR105W 327 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 ADH5YBR145W 1056 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 ATP16YDL004W 483 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 YJL068CYJL068C 900 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 APS2YJR058C 444 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 MRPL16YBL038W 699 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 TEX1YNL253W 1269 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 RPB8YOR224C 441 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 TIF3YPR163C 1311 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 MSB3YNL293W 1902 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 HXT13YEL069C 1695 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 PAR32YDL173W 888 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 PDS1YDR113C 1122 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 YDR282CYDR282C 1245 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 RPL2AYFR031C-A 765 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 DOG2YHR043C 741 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 DOG1YHR044C 741 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 AIM19YIL087C 474 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 BAT2YJR148W 1131 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 YLR030WYLR030W 792 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 YMR007WYMR007W 381 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 NRK1YNL129W 723 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 NOP13YNL175C 1212 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 TRM10YOL093W 882 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 YOR292CYOR292C 930 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 HMS1YOR032C 1305 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 GFA1YKL104C 2154 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 SHM1YBR263W 1473 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 MOB2YFL034C-B 864 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 HSP150YJL159W 1242 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 SUR7YML052W 909 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 YMR226CYMR226C 804 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 YOR283WYOR283W 693 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-DR3Q12441 RBD2YPL246C 789 nt6.91□□□□□ -1.3
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