Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cib3Q0P523 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms