Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TrioQ0KL02 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TrioQ0KL02 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TrioQ0KL02 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TrioQ0KL02 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TrioQ0KL02 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TrioQ0KL02 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TrioQ0KL02 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TrioQ0KL02 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TrioQ0KL02 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TrioQ0KL02 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TrioQ0KL02 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TrioQ0KL02 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TrioQ0KL02 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TrioQ0KL02 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TrioQ0KL02 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TrioQ0KL02 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TrioQ0KL02 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TrioQ0KL02 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TrioQ0KL02 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TrioQ0KL02 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TrioQ0KL02 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrioQ0KL02 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrioQ0KL02 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TrioQ0KL02 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrioQ0KL02 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrioQ0KL02 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TrioQ0KL02 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TrioQ0KL02 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TrioQ0KL02 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TrioQ0KL02 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TrioQ0KL02 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TrioQ0KL02 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TrioQ0KL02 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TrioQ0KL02 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TrioQ0KL02 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TrioQ0KL02 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrioQ0KL02 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrioQ0KL02 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrioQ0KL02 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrioQ0KL02 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrioQ0KL02 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrioQ0KL02 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrioQ0KL02 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrioQ0KL02 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TrioQ0KL02 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TrioQ0KL02 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TrioQ0KL02 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TrioQ0KL02 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TrioQ0KL02 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TrioQ0KL02 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TrioQ0KL02 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TrioQ0KL02 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TrioQ0KL02 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TrioQ0KL02 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TrioQ0KL02 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.6 ms